STW-project: de analyse van routine testen op biologische afbraak
Doelstelling van het project
Het project heeft drie doelstellingen:
- De Dynamische Energie Budget theorie voor de metabole
organisatie van organismen gebruiken voor het opstellen van modellen
voor de afbraak van chemische stoffen door microorganismen.
- Deze modellen testen tegen data uit routinematige bioassays voor
afbraak van stoffen, en maten vinden om realistisch vast te leggen hoe
snel de afbraak gaat.
- Een computer programma schrijven om de toepassing van de
modellen en het berekenen van de maten voor afbraaksnelheden uit
experimentele resultaten te vergemakkelijken.
Resultaten
Het project heeft zich op drie topics toegespitst, die in de bestaande
literatuur tot nu toe erg zwak waren uitgewerkt.
- De groei van microorganismen in vlokken in plaats van in
suspensie, waardoor het stoftransport en dus de afbraak een heel
stuk langzamer verloopt. In zuiveringsinstallaties, die zorg moeten
dragen voor het verwijderen van stoffen, groeien de microorganismen
eigenlijk alleen in de vorm van vlokken, terwijl de literatuur over
suspensies gaat.
- Het verschijnsel "co-metabolisme": sommige stoffen worden alleen
afgebroken als er andere stoffen aanwezig zijn. Het project heeft een
model opgeleverd dat de gezamenlijk afbraak van stoffen
kwantificeert.
- Het verschijnsel "adaptatie": als een organisme een stof in
princiepe wel kan afbreken, maar daar niet recent aan is
blootgesteld, dan kan het even duren voordat de afbraak op gang
komt. De moleculaire machinerie voor deze afbraak moet eerst worden
aangelegd. Ook kunnen andere stoffen de aanmaak van deze machinerie
onderdrukken, en komt de afbraak alleen op gang als deze remmende
stoffen zijn verdwenen.
Voor alle drie de verschijnselen zijn relatief eenvoudige modellen
gemaakt; het computerprogramma DEBtox, dat de afdeling Theoretische
Biologie van de VU heeft geschreven voor het analyseren van
toxiciteitsdata, wordt binnenkort uitgebreid met een module voor de
afbraak van stoffen. Het programma is vrij-downloadbaar vanaf het
electronisch DEB laboratorium:
http://www.bio.vu.nl/thb/deb/.
Meer informatie over dit project, inclusief de publikatielijst, is te
vinden op de website van de afdeling: http://www.bio.vu.nl/thb/.
Publiciteit
- Caspers, S. (2002) Model lokt bacteriën.
Natuur & Techniek 70 (10) oktober 2002 pag 13
- Wayenburg, B. van (2002) Een boekhouding voor biologische afbraak.
Parool vrijdag 13 sept 2002, pag 8-9 wetenschapsbijlage
Go to projects' entry